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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura.
Data corrente:  13/10/2021
Data da última atualização:  28/10/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  VARELA, E. S.; BEKAERT, M.; KIRSCHNIK, L. N. G.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; O'SULLIVAN, F. L. A.; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; BARROSO, A. da S.; FREITAS, L. E. L. de; TAGGART, J. B.; MIGAUD, H.
Afiliação:  EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; MICHAËL BEKAERT; LUCIANA NAKAGHI GANECO KIRSCHNIK, CNPASA; LUCAS SIMON TORATI, CNPASA; LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; FERNANDA LOUREIRO ALMEIDA OSULLIVAN, CPAA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; FABRICIO PEREIRA REZENDE, CNPASA; AURISAN DA SILVA BARROSO; LUIZ EDUARDO LIMA DE FREITAS, CNPASA; JOHN BERNARD TAGGART; HERVE MIGAUD.
Título:  A high-density linkage map and sex-linked markers for the Amazon tambaqui Colossoma macropomum.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 22, n. 709, 2021.
ISSN:  1471-2164
DOI:  https://doi.org/10.1186/s12864-021-08037-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Tambaqui (Colossoma macropomum, Cuvier, 1818) is the most economically important native freshwater fish species in Brazil. It can reach a total length of over 1 m and a weight of over 40 kg. The species displays a clear sex dimorphism in growth performance, with females reaching larger sizes at harvest. In aquaculture, the production of monosex populations in selective breeding programmes has been therefore identified as a key priority. In the present study, a genetic linkage map was generated by double digest restriction-site associated DNA (ddRAD) sequencing from 248 individuals sampled from two F1 families. The map was constructed using 14,805 informative SNPs and spanned 27 linkage groups. From this, the tambaqui draft genome was improved, by ordering the scaffolds into chromosomes, and sex-linked markers were identified. A total of 235 markers on linkage group 26 showed a significant association with the phenotypic sex, supporting an XX/XY sex determination system in the species. The four most informative sex-linked markers were validated on another 206 sexed individuals, demonstrating an accuracy in predicting sex ranging from 90.0 to 96.7%.
Palavras-Chave:  Linkage map; Monosex; Sex-linked markers.
Thesagro:  Aquicultura; Colossoma Macropomum; Peixe; Tambaqui.
Thesaurus Nal:  Aquaculture; Fish; Genetic markers; Sex determination.
Categoria do assunto:  --
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/227302/1/bmc-2021.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/226902/1/s12864-021-08037-8.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPASA1076 - 1UPCAP - DD20212021
CPAA38559 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L.; TAYLOR, J.; MESQUITA, P.; MIGAUD, H. Effects of GnRHa slow-release implants in the steroid profile of isolated couples of Arapaima gigas (Schinz, 1822). In: AQUACULTURE EUROPE 2016, 2016, Edinburgh, Scotland. Food for thought. Edinburgh: European Aquaculture Society, 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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2.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; ALBALAT, A.; MESQUITA, P. E.; TAYLOR, J.; MIGAUD, H. Cephalic secretion of Arapaima gigas: sex steroids, peptides and proteins suggest roles in chemical communication and parental care. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. p. 63.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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3.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; LIMA, A. F.; MIGAUD, H. Oocyte development in pirarucu Arapaima gigas (Schinz, 1822). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AQUICULTURA E BIOLOGIA AQUÁTICA, 9., 2021. AQUACIÊNCIA DIGITAL 2021. [S.l.]: Aquabio, 2021.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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4.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; TAYLOR, J. F.; MESQUITA, P. E. C.; MIGAUD, H. GnRHa implants and size pairing effects on plasma and cephalic secretion sex steroids in Arapaima gigas. General and Comparative Endocrinology, v. 299, 113614, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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5.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; LIMA, A. F.; KIRSCHNIK, L. N. G.; MIGAUD, H. Canulação como técnica de baixo custo para identificação do sexo e condição reprodutiva em fêmeas de pirarucu Arapaima gigas. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2022. 14 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Comunicado técnico, 9).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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6.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; LIMA, A. F.; KIRSCHNIK, L. N. G.; MIGAUD, H. Canulação como técnica de baixo custo para identificação do sexo do pirarucu Arapaima gigas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AQUICULTURA E BIOLOGIA AQUÁTICA, 10., 2023, Florianópolis. Conservar, produzir e inovar: anais eletrônicos. Florianópolis: Aquabio, 2023. Aquaciência 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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7.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; VARGES, A. P. S.; GALVÃO, J. A. S.; MIGAUD, H. Endoscopy application in broodstock management of Arapaima gigas (Schinz, 1822). Journal of Applied Ichthyology, v. 32, n. 2, p. 353-355, Apr. 2016. Short communication.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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8.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; LIMA, A. F.; KIRSCHNIK, L. N. G.; MIGAUD, H. Endoscopy and cannulation as non-invasive tools to identify sex and monitor reproductive development in Arapaima gigas. Copeia, v. 107, n. 2, p. 287?296, July 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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9.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; TAGGART, J. B.; VARELA, E. S.; ARARIPE, J.; WEHNER, S.; MIGAUD, H. Genetic diversity and structure in Arapaima gigas populations from Amazon and Araguaia-Tocantins river basins. BMC Genetics, v. 20, n. 13, Jan. 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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10.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; LIMA, A. F.; MESQUITA, P. E. C.; TAGGART, J. B.; ALBALAT, A.; TAYLOR, J.; MIGAUD, H. Advances into the captive reproduction of the amazon pirarucu (Osteoglossidae: Arapaima). In: FENACAM & LACQUA/SARA (WAS)'15.; LATIN AMERICAN & CARIBBEAN AQUACULTURE 15.; SOUTH AMERICAN REGIONAL AQUACULTURE 15.; INTERNATIONAL SHRIMP FARMING SYMPOSIUM, 12.; INTERNATIONAL ACQUACULTURE TRADE SHOW, 12.; INTERNATIONAL AQUACULTURE SYMPOSIUM, 9.; TILAPIA ECONOMIC FORUM, 3., 2015, Fortaleza. Abstracts... Fortaleza: ABCC: World Aquaculture Society, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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11.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; MIGAUD, H.; DOHERTY, M. K.; SIWY, J.; MULLEN, W.; MESQUITA, P. E. C.; ALBALAT, A. Comparative proteome and peptidome analysis of the cephalic fluid secreted by Arapaima gigas (Teleostei: Osteoglossidae) during and outside parental care. Plos One, v. 12, n. 10, e0186692, Oct. 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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12.Imagem marcado/desmarcadoVARELA, E. S.; BEKAERT, M.; KIRSCHNIK, L. N. G.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; O'SULLIVAN, F. L. A.; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; BARROSO, A. da S.; FREITAS, L. E. L. de; TAGGART, J. B.; MIGAUD, H. A high-density linkage map and sex-linked markers for the Amazon tambaqui Colossoma macropomum. BMC Genomics, v. 22, n. 709, 2021.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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